Claro, posso ajudar a explicar os usos das vírgulas nesta frase:
Após "d. Laura": A vírgula é usada aqui para introduzir uma oração subordinada adjetiva explicativa. As orações explicativas são intercaladas na frase para adicionar uma informação relevante sobre o sujeito (no caso, sobre "d. Laura") e são sempre isoladas por vírgulas.
Após "que" (primeira ocorrência): Esta vírgula marca o início do par de vírgulas que isolam a oração subordinada adjetiva explicativa "não sendo formosa que o inquietasse, nem feia que lhe repugnasse." Esta oração fornece uma descrição adicional sobre "d. Laura," explicando que ela não era nem tão bonita a ponto de causar insegurança, nem feia a ponto de repugnar.
Após "inquietasse,": Aqui, a vírgula está dividindo os dois elementos de uma construção negativa paralela: "não sendo formosa que o inquietasse" e "nem feia que lhe repugnasse." A vírgula separa essas duas partes contrastantes da explicação.
Após "repugnasse,": Esta vírgula fecha a oração subordinada adjetiva explicativa que começou após "Laura." A oração até aqui explica certas características de "d. Laura."
Após "ele.": Marca o fim da oração principal e a introdução de outra definição sobre "d. Laura," que é sua superioridade intelectual.
Após "ascendente,": Separa a oração principal da oração subordinada adverbial de modo "de que ela usava e abusava no lar doméstico," a qual explica como ela usava sua superioridade.
Após "doméstico,": Esta vírgula introduz a parte final da sentença "onde só a sua vontade e a sua opinião prevaleciam sempre," que especifica onde e em que contexto a superioridade de "d. Laura" se manifesta.
Essas vírgulas são utilizadas para marcar as delimitações das orações e separar elementos que oferecem explicações ou detalhes adicionais na frase, seguindo as regras da sintaxe portuguesa.