A frase "Você sim merece vencer" está gramaticalmente correta, mas o uso de vírgulas pode ajudar a dar ênfase e clareza à ideia que se quer transmitir. Para dar ênfase ao "sim", você pode usar vírgulas antes e depois da palavra, assim: "Você, sim, merece vencer."
A presença das vírgulas destaca a afirmativa e enfatiza que, de fato, é "você" quem merece vencer. Ambas as formas são corretas, mas o uso de vírgulas pode tornar a intenção da frase mais clara.