Carbono secundário é aquele que realiza ligações com mais 2 carbonos. Ou seja, cada ponta de uma linha que é um carbono, deve estar conectado por 2 linhas, é como se fosse o vértice de um desenho. Os secundários no nano kid podem ser observados na testa, nas ligações triplas, algumas ligações duplas, e nas pernas. Já os carbonos terciários são ligados por 3 linhas, e estão no queixo, na ligação do braço com o tronco, e das pernas com o tronco.
