Durante a diferenciação celular, o glicocálix desempenha importante função, relacionada a seus receptores, assimilando estímulos que irão reger a organogênese, ou seja, a formação e distinção dos tecidos e órgãos, indicativo de sua composição específica conforme o tipo celular. O glicocálix permite que a célula se diferencie e forme, por exemplo, uma célula hepática, uma hemácia ou outro tipo de célula.