O fluxo de energia ao longo dos níveis tróficos em um ecossistema diminui principalmente devido a duas razões principais:
Perda de energia na forma de calor: À medida que a energia passa de um nível trófico para outro, uma parte significativa dela é perdida na forma de calor durante os processos metabólicos dos organismos. Isso ocorre porque nenhum processo é 100% eficiente em converter energia de uma forma para outra. Por exemplo, quando os produtores (plantas) realizam a fotossíntese para converter energia solar em energia química, parte dessa energia é perdida na forma de calor. Quando os herbívoros consomem os produtores, eles também perdem energia na forma de calor durante a respiração, metabolismo e movimento. Esse processo de perda de energia continua ao longo dos níveis tróficos, resultando em uma diminuição gradual do fluxo de energia.
Eficiência na transferência de energia: Nem toda a energia contida em um organismo é transferida eficientemente para os consumidores que o consomem. A eficiência na transferência de energia varia de acordo com fatores como a digestibilidade dos alimentos, a taxa de crescimento dos consumidores, a eficiência na captura de presas (no caso de consumidores carnívoros) e outros fatores ecológicos. Como resultado, apenas uma fração da energia disponível em um nível trófico é transferida para o próximo nível, o que contribui para a diminuição do fluxo de energia.
Quanto à devolução da matéria orgânica que os seres vivos recebem, isso ocorre principalmente através do processo de decomposição. Quando os organismos morrem, seus corpos são decompostos por microrganismos, como bactérias e fungos, que quebram a matéria orgânica em compostos mais simples. Durante esse processo, os nutrientes contidos nos corpos dos organismos mortos são liberados de volta ao ambiente na forma de compostos inorgânicos, como dióxido de carbono, água e minerais. Esses nutrientes podem então ser reutilizados pelos produtores para iniciar novamente o ciclo de produção de matéria orgânica, completando assim o ciclo de nutrientes em um ecossistema.