A teoria da biogênese pressupõe que todos os seres vivos são originados de outros seres vivos preexistentes, contrapondo a teoria da geração espontânea. Portanto, as moscas que surgiam na carne não se originavam dela, mas sim de outras moscas presentes no ar, por exemplo. Os principais defensores da biogênese foram: Ernest Haeckel, Thomas Henry Hurley, Stanley Miller, Lázzaro Spallanzani, Francesco Redi e Louis Pasteur.
Ao contrário da teoria da abiogênese, a teoria da biogênese se originou para contrapor a ideia de que a matéria bruta poderia originar um novo ser. Segundo a biogênese, todos os seres vivos são originados de outros seres vivos preexistentes, ou seja, um rato não pode nascer a não ser de outro rato. Espécies de anfíbios e répteis só podem nascer de espécies preexistentes desses animais.