Como o próprio nome sugere, as bactérias anaeróbicas facultativas podem tanto realizar respiração aeróbica( quando houve presença de oxigênio), quanto realizar respiração anaeróbica caso falte o oxigênio. Respondendo sua pergunta em um meio onde há oxigênio, a respiração anaeróbica é "desligada", sendo assim elas realizariam somente a respiração aeróbica!