Sim, a frase está escrita corretamente. Você expressou claramente que hoje se completam 6 anos desde o falecimento do seu pai e também 6 anos de idade do seu sobrinho, ressaltando que seu pai faleceu no dia em que seu sobrinho nasceu. Aqui está a frase revisada:
"Hoje completa 6 anos que meu pai morreu e 6 anos de idade do meu sobrinho. Assim que meu sobrinho nasceu, meu pai morreu."
Se precisar de mais alguma coisa, estou à disposição.