A rafinose é um tipo de oligossacarídeo, ou seja, um carboidrato composto por um pequeno número de monossacarídeos unidos. Especificamente, a rafinose é um trisacarídeo, formado por três unidades de monossacarídeos: glicose, frutose e galactose. Na rafinose, a glicose e a galactose estão unidas por uma ligação glicosídica alfa-1,6, e a frutose está ligada à glicose por uma ligação beta-1,2.
A rafinose é encontrada em várias plantas, especialmente em leguminosas como feijão, bem como em vegetais como repolho, brócolis e aspargos. Ela não é facilmente digerida pelos humanos porque carecemos das enzimas necessárias para quebrar as ligações específicas que compõem a rafinose. Em vez disso, a rafinose passa pelo trato digestivo até atingir o cólon, onde é fermentada por bactérias, frequentemente resultando na produção de gases como hidrogênio, metano e dióxido de carbono, que podem levar ao desconforto gastrointestinal.