Em um artigo, o termo "transtorno do espectro autista" e "transtorno de déficit de atenção e hiperatividade" devem ser escritos com letra minúscula, a não ser que estejam no início de uma frase ou que façam parte de um título. A norma é que nomes de doenças e transtornos são tratados como substantivos comuns e, por isso, não requerem maiúsculas em seu uso corrente.
Portanto, você pode escrever "transtorno do espectro autista" e "transtorno de déficit de atenção e hiperatividade" em minúsculas ao longo do texto, a menos que as regras específicas de estilo que você está seguindo indiquem o contrário.