A sequência correta é:
V - V - F.
Vamos analisar cada asserção:
Os nativos, não considerados nem hereges e nem pagãos, ficaram sem o reconhecimento de sujeitos em condição de igualdade com os portugueses. - Verdadeira (V). Durante a colonização, mesmo que fossem considerados povos gentis, os indígenas não eram vistos como iguais pelos colonizadores europeus.
A população nativa passou pelo recrutamento forçado para o trabalho e muitos outros tipos de violência. - Verdadeira (V). Os indígenas enfrentaram diversas formas de violência, incluindo o trabalho forçado e outras agressões, durante o processo colonial.
O abuso sexual e estupro das Indígenas, além de massacres continuados, eram comuns, além das tentativas de extermínio que só se encerraram com a Constituição Federal de 1988. - Falsa (F). Embora a Constituição de 1988 tenha sido um marco para os direitos indígenas no Brasil, as tentativas de extermínio e abusos contra indígenas não terminaram com sua promulgação. Tais questões ainda são desafios enfrentados hoje, embora em novos contextos e formas de resistência. Isso evidencia que os problemas não se encerraram em uma data específica, mas vêm de um contexto histórico contínuo.