O certo é:
Bom dia! Tudo bem?
Ou
Bom dia, tudo bem?
Juliana, veja:
Bom dia, X! Tudo bem?
A 1a. é uma saudação separada do vocativo por vírgula e com ponto de exclamação. A 2a. é uma pergunta, às vezes retórica.
Espero tê-la ajudado. At.te, tutor Miguel Augusto Ribeiro.
Olá, Juliana!
Escreva sempre a saudação separada da pergunta.
"Bom dia!"
"Tudo bem?"
São duas frases, portanto as duas têm sentido completo. E, além disso, escritas dessa forma, demonstram mais simpatia e cuidado.
Um ótimo domingo, Juliana!
Espero tê-la ajudado.