Sim.
item I: O sujeito não aparece expresso, mas é identificado a partir do verbo em 3a pessoa (chegou).
item II: São os pronomes "o", em "botou-O" e o pronome "ele", em "ELE veio" que retomam o sujeito Paulo no primeiro período do segundo parágrafo.
OBS.: O uso dos pronomes pessoais retos ou oblíquos depende da função sintática que exercem. Grosso modo, os pronomes retos funcionam como sujeitos, (em ele veio, o pronome é o sujeito do verbo vir) enquanto os oblíquos funcionam como objetos (botou-o, na linguagem coloquial seria "botou ele", esse "ele" recebe a ação do verbo, sendo, portanto, um objeto). Quanto à classificação aplicada aos pronomes oblíquos, átonos ou tônicos, é apenas uma classificação baseada na pronúncia (portuguesa, pois no Brasil os pronomes átonos adquiriram tonicidade na fala), não fazendo diferença nos contextos de uso, como a questão que você expôs.