A representação estereoquimicamente exata do ectocarpeno, levando em consideração a configuração absoluta do centro quiral S e as ligações duplas cis, na notação de linhas de ligação, seria a seguinte:
CH3CH2CH=CHCH3
Esta fórmula representa a cadeia principal do ectocarpeno, com uma ligação dupla cis (indicada pelo sinal de igualdade) entre o terceiro e o quarto carbono, e uma ramificação metila (CH3) no quarto carbono.