Mutualismo pode ser classificado de duas maneiras distintas, sendo elas o Mutualismo Facultativo, no qual as duas espécies podem viver separadamentes, mas possuem beneficios ao se associar, sendo uma relação do tipo ++ ou +0 (+ Indicando beneficios, e 0 não beneficiado, mas não sendo prejudicado tambem) podendo citar como exemplo deste caso o carangueijo eremita, que diferente dos demais carangueijos não possui carapaça rigida na porção do abdomem, assim se associando a conchas avbandonadas, que estão geralmente associadas as anêmonas, que acabam por protege-lo graças as suas células urticantes.
O outro caso, é o Mutualismo obrigatório, no qual as duas espécies dependem uma da outra para a sobrevivência, podendo usar como exemplo os Liquens, no qual fungos "Alimentam" com água e nutrientes absorvidos do meio as algas ou bactérias que por sua vez fornecem ao fungo os açucares por eles sintetizados.